O Instituto foi fundado no dia 20 de fevereiro de 2005, com o nome de Associação Fala Guri, contudo, a partir do planejamento estratégico 2012, a organização passou a assumir o nome de Instituto Abaçaí, ampliando a atuação até então regional para nacional.

No planejamento daquele ano ficou estabelecido que atuação do grupo para os próximos anos seria o fomento ao Desenvolvimento Social Local, através da mobilização, integração e capacitação dos três setores da sociedade.

Tendo uma nova missão, diretoria e nome, o instituto decidiu desenvolver e nacionalizar como projeto prioritário o Selo Social, já que contava em seu quadro de sócios com os idealizadores, desenvolvedores e coordenadores do Selo Social de Itajaí e Brusque.

A partir de 2014, com a popularização e crescimento do programa Selo Social, o Instituto passa a ser reconhecido em seus diversos territórios de atuação por equipe do Selo Social, e desta forma passou naturalmente a assumir o nome Instituto Selo Social.

Ao longo dessa história, a equipe do instituto realizou então uma série de estudos, pesquisa e planejamento para elaborar um modelo de implementação e execução para o projeto Selo Social, que possibilita sua ampliação e desenvolvimento desvinculado de amarras políticas e econômicas, gerando a autonomia necessária para o cumprimento de seu papel de: Estimular o Desenvolvimento Social Local, por meio de capacitação e reconhecimento, envolvendo e comprometendo os três setores da sociedade.

Esse fomento foi realizado primeiramente tendo como diretrizes os Objetivos do Milênio da ONU, que em 2015 foram ampliados para os Objetivos de Desenvolvimento Sustentável. Esses objetivos internacionais guiam a construção de projetos e registro de impactos sociais de modo a territorializar e trazer a corresponsabilidade de cada pessoa e instituição por um mundo mais justo e inclusivo.

Com o despertar deste sentimento de pertencimento de território, as organizações desenvolvem parcerias e adotam novos comportamentos corporativos para cumprimento da Agenda 2030.

O Instituto Selo Social já atuou em cidades de Santa Catarina, Paraná, Minas Gerais, São Paulo e no Distrito Federal e atende anualmente mais de 500 organizações com capacitação, estímulo e reconhecimento de projetos de impacto social local.